Institutional Repository of Xishuangbanna Tropical Botanical Garden
| 风筝果种子累积蓖麻油酸过程中的转录组分析 | |
| 陆添权; 田波 | |
| 2018 | |
| Conference Name | 中国植物学会八十五周年学术年会 |
| Source Publication | 中国植物学会八十五周年学术年会论文摘要汇编（1993-2018） |
| Pages | 544 |
| Conference Date | 2018-10-10 |
| Abstract | 风筝果(Hiptage benghalensis)属金虎尾科风筝果属植物,为藤本或藤状灌木,主要分布于热带亚洲,在我国分布范围较广,在云南、贵州、广西、广东、福建、海南和台湾均有分布。风筝果种子含油率较高(约50%),脂肪酸组成与蓖麻种子相似,蓖麻油酸含量约80%,除蓖麻外,风筝果是唯一已知大量累积蓖麻油酸的植物。蓖麻油酸是重要的工业原料,但蓖麻油酸在植物中的累积机制尚待进一步研究。本研究在分析风筝果种子发育过程中脂肪酸累积规律的基础上,对不同发育时期种子的转录组进行了比较分析,运用二代转录组(Illumina sequencing)和三代全长转录组测序(SMRT sequencing)数据,通过富集分析、差异表达分析、共表达网络分析等生物信息学分析方法,对油脂代谢相关基因,及与其相关的转录因子、长片段非编码RNA (lncRNA)、可变剪接进行了分析。结果表明,FAH12是蓖麻油酸合成的关键酶,Lands Cycle途径可能在蓖麻油酸累积过程中起关键作用,其中LPCAT1和PDAT2可能是关键酶,另外,SAD、KASII、PXG2、ACBP6和OLE3可能在蓖麻油酸合成、转移、累积过程中起到重要作用,其中PXG2可能参与蓖麻油酸的合成,OLE3可能参与酰基转移和磷脂水解的反应;转录因子中除功能较明确的WRI1,FUS3,LEC1,和ABI3外,bZIP67的表达量较高且与油脂代谢关键基因存在较强的相关性,可能在风筝果种子累积蓖麻油酸中起到重要作用;四个lncRNA(PB24473,PB56338,PB3144,和PB6000)与关键油脂代谢基因具有较强的相关性,均为未知的lncRNA,其功能尚不明确,可能在蓖麻油酸累积过程中具有一定的作用;可变剪接在风筝果种子油脂代谢相关基因中广泛存在,但大多数可变剪接异构体的表达量较低,预测的可变剪接异构体的数量较少,在无参考基因组物种中的可变剪接预测方法有一定的局限性,还有待于进一步研究改进。本研究结果将有利于更好的理解植物种子累积蓖麻油酸的分子机制,将为风筝果开发为替代蓖麻的新能源植物以及通过基因工程手段生产蓖麻油打下基础。 |
| Department | 版纳植物园会议文献 |
| Keyword | 风筝果 蓖麻油酸 转录组 共表达网络 种子 |
| Language | 中文 |
| Document Type | 会议论文 |
| Identifier | https://ir.xtbg.ac.cn/handle/353005/15040 |
| Collection | 版纳植物园会议文献 |
| Affiliation | 中国科学院西双版纳热带植物园热带植物资源可持续利用重点实验室 |
| First Author Affilication | 中国科学院西双版纳热带植物园 |
| Recommended Citation GB/T 7714 | 陆添权,田波. 风筝果种子累积蓖麻油酸过程中的转录组分析[C],2018:544. |
| Files in This Item: | ||||||
| File Name/Size | DocType | Version | Access | License | ||
| 风筝果种子累积蓖麻油酸过程中的转录组分析（760KB） | 会议论文 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | Application Full Text | ||
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