| 锦葵科Malvatheca分支的质体基因组演化及系统发育分析 | |
雷翰霖; 黎若竹; 蔡杰; 杨俊波; 张志荣; 李德铢; 郁文彬
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| 2025 | |
| Source Publication | 广西植物
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| ISSN | 1000-3142 |
| Volume | xIssue:xPages:1-21 |
| Abstract | 广义锦葵科（Malvaceae s.l.）Malvatheca分支（含锦葵亚科和木棉亚科）具有重要经济和生态价值，但其内部系统发育关系存在争议，特别是绵绒树族、轻木族和南瓜榄族的系统位置。目前，Malvatheca分支的质体基因组多样性演化还缺乏较为全面的研究。该研究整合了Malvatheca分支8族38属142种的质体全基因组数据，包括新组装77个质体基因组，开展了质体基因组比较及系统发育分析。结果表明：（1） Malvatheca分支的质体基因组大小变化范围为156 701～163 741 bp，其变化主要受反向重复（IR）区长度与重复序列的数量影响。（2）通过分析IR和SC区域边界基因的差异确定了4种IR边界类型，其中类型Ⅲa被推断为Malvatheca分支的祖先结构类型，相似的IR区收缩和扩张事件在该分支演化过程中独立发生多次。（3）锦葵亚科和木棉亚科分别检测到8个高变区，其中trnSGCU-trnGUCC、petA-psbJ、ndhD-ccsA及ycf1为2个亚科共有高变区。此外，trnSGCU-trnGUCC、ycf1及常用分子标记ndhF在2个亚科中均表现出较强的系统发育分辨力。（4）基于质体全基因组矩阵（WGM）和编码序列矩阵（CDS）的系统发育拓扑结构基本一致，为Malvatheca分支提供了可靠的系统发育框架。结果显示Malvatheca分支早期演化形成4个分支，其中绵绒树族为最早分化类群，随后为轻木族，锦葵亚科与木棉亚科互为姐妹。此外，猴面包树族、木棉族、木槿属和黄花稔属均非单系，这些类群的组成和分类学处理仍需进一步研究。该研究利用迄今为止取样最广泛的质体基因组数据集，揭示了Malvatheca分支内部的主要系统发育关系，并为理解该分支质体基因组特征与演化提供了新的见解。 |
| Keyword | Malvatheca分支 系统发育 质体基因组 木棉亚科 锦葵亚科 锦葵科 |
| Language | 中文 |
| Document Type | 期刊论文 |
| Identifier | https://ir.xtbg.ac.cn/handle/353005/14821 |
| Collection | 2012年后新成立研究组 |
| Affiliation | 1.中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心和云南省热带雨林与亚洲象保护重点实验室 2.中国科学院西双版纳热带植物园云南省热带珍贵用材树种保护与利用国际联合实验室 3.中国科学院大学 4.中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库 5.中国科学院东南亚生物多样性研究中心 |
| Recommended Citation GB/T 7714 | 雷翰霖,黎若竹,蔡杰,等. 锦葵科Malvatheca分支的质体基因组演化及系统发育分析[J]. 广西植物,2025,x(x):1-21. |
| APA | 雷翰霖.,黎若竹.,蔡杰.,杨俊波.,张志荣.,...&郁文彬.(2025).锦葵科Malvatheca分支的质体基因组演化及系统发育分析.广西植物,x(x),1-21. |
| MLA | 雷翰霖,et al."锦葵科Malvatheca分支的质体基因组演化及系统发育分析".广西植物 x.x(2025):1-21. |
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| 锦葵科Malvatheca分支的质体基因（2651KB） | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | View Download | |
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